РКК «Энергия» выиграла контракт на создание НЭМа на государственных торгах 30 октября 2012 года, предложив цену 15,15 млрд рублей. На первом этапе контракта исполнитель должен был разработать эскизный проект с целью установления и обоснования основных характеристик изделия, технических и технологических решений, дающих общее представление о принципах работы модуля и его устройстве. 

«Энергия» разработала эскизный проект в первом полугодии 2013 года и проинформировала об этом Роскосмос, который предложил провести экспертизу проекта во ФГУП ЦНИИмаш, что является стандартной процедурой: ЦНИИмаш — это головная научная структура Роскосмоса. 

В течение года ЦНИИмаш, Роскосмос, Минобороны и РКК «Энергия» обменивались письмами, согласовывая сроки, форму и способ оплаты экспертизы. К концу мая 2014 года срок исполнения экспертизы наконец удалось согласовать, в июне 2014 года ЦНИИмаш выдал заключение с рядом существенных претензий. Основные были обусловлены отсутствием материалов на ракету-носитель «Протон» в обеспечение запуска НЭМа, что не позволяло  «оценить реализуемость обеспечения вывода космической головной части с научно-энергетическим модулем на опорную орбиту». В итоге ЦНИИмаш забраковал как сам эскизный проект, так и техническое задание Роскосмоса, по которому работали проектанты «Энергии». 

В августе 2014 года «Энергия» согласовала с заказчиком акт доработки эскизного проекта, все проектные материалы были направлены в Роскосмос. Представители этой организации сообщили, что проект будет вынесен на рассмотрение ее научно-технического совета (НТС), но только после проведения еще одной экспертизы ЦНИИмаша. Однако дополнительная экспертиза не предусмотрена нормативно-техническими документами — ее проведение требовало разработки нового техзадания, согласования и заключения специального договора, а также выделения дополнительного бюджетного финансирования.

В итоге на рассмотрение НТС Роскосмоса проект был вынесен 12 ноября 2014 года без проведения дополнительной экспертизы. НТС указал на непроработанность вопроса о возможности ракеты вывести модуль в космос вместе со сборочно-защитным блоком (СЗБ), то есть, по сути, отметил необходимость эскизного проектирования только при наличии так и не предоставленного Роскосмосом технического задания на ракетно-космический комплекс «Протон-НЭМ».

В конце мая 2015 года доработанный эскизный проект НЭМ вновь прошел экспертизу в ЦНИИмаше, где опять отметили, что такие проекты рассматриваются только в связке с ракетой-носителем. 

Это последнее событие в хронологии изученных судом фактов. Из них следует, что переписка между Роскосмосом, его головной научной организацией и контролируемой Роскосмосом компанией «Энергия» длилась почти 2 года. Всё это время представители родственных организаций сообщали друг другу, что при проектировании уникальных нагрузок нужно иметь в виду возможности ракеты-носителя.

В Роскосмосе решение суда по сути комментировать не стали, отметив, что иск к «Энергии» был подан потому, что так требует делать законодательство. 

— Из текста решения усматривается, что сотрудники Роскосмоса отнеслись халатно ко всем этапам выполнения контракта, начиная с составления договора, — констатирует Татьяна Гончарова, управляющий партнер юридической компании LexProf. — Суд установил, что приложение к договору — техническое задание — составлено с нарушением отраслевых нормативных документов. Неправильно был определен сам предмет договора, потому что и НТС Роскосмоса и ЦНИИмаш указали, что техническое задание должно выдаваться на весь ракетно-космический комплекс, а не только на НЭМ. Судом также установлен факт, что Роскосмос на 11 месяцев просрочил выдачу необходимой документации. Если это решение суда устоит в апелляционной инстанции, то может стать основой для принятия мер административного и гражданско-правового характера к конкретным сотрудникам космического агентства.

В РКК «Энергия» от комментариев воздержались.