Ракета-носитель «Союз-У» с транспортным грузовым кораблем «Прогресс МС-03» вывезена на стартовый комплекс площадки №31 космодрома Байконур. Ракета установлена в пусковую систему. Начаты работы по графику первого стартового дня.
 
Пуск ракеты-носителя «Союз-У» с ТГК «Прогресс МС-03» запланирован в 00:41 мск 17 июля 2016 года. Прямая трансляция пуска начнется 16 июля в 22:40 мск на сайте Роскосмоса.
 
Программа полета «космического грузовика» предусматривает 2-х суточную схему сближения с МКС. Расчётное время стыковки корабля с МКС 03:22 мск 19 июля 2016 года.
 
Корабль доставит на Международную космическую станцию более 2,4 тонн различных грузов, в том числе: топливо, воздух, кислород, продукты питания, оборудование для поддержания функционирования станции и посылки для членов экипажа.