По итогам января – марта 2017 года в рамках постановления Правительства Российской Федерации от 25 декабря 2013 года №1242 аэропорт Толмачёво обслужил на субсидируемых региональных воздушных линиях 1415 пассажиров (+270% по сравнению с аналогичным периодом 2016 года на этих же направлениях). 

С начала 2017 года в рамках реализации данного постановления ведётся государственная поддержка рейсов из Новосибирска в Байкит, Томск и Ханты-Мансийск. С апреля начинается субсидирование рейсов в Горно-Алтайск, Нижневартовск, Новый Уренгой, Ноябрьск, Стрежевой и Сургут. 

В рамках постановления Правительства РФ от 29 декабря 2009 г. №1095 «Об утверждении Правил предоставления субсидий организациям воздушного транспорта в целях обеспечения доступности воздушных перевозок пассажиров с Дальнего Востока в европейскую часть страны и в обратном направлении» осуществляются субсидированные авиаперевозки отдельных категорий граждан из Новосибирска. 

С 1 апреля по 31 октября 2017 года программа господдержки по этому постановлению действует на маршрутах между Новосибирском и Владивостоком, Читой, Магаданом, Мирным, Полярным, Хабаровском, Якутском и Петропавловском-Камчатским.

В 2016 году в рамках постановления Правительства РФ от 29 декабря 2009 г. №1095 из Новосибирска в города Дальнего Востока и обратно было перевезено 579 600 пассажиров.